此时，为了能够统一有效的指挥沿长江进攻的华中派遣军各师团，组建了第11军，以冈村宁次为司令官，而根据6月15日御前会议的决定，6月18日大本营又以大陆命第119号正式下达了实施汉口作战的预先号令，确定大本营企图于初秋攻占汉口。华中派遣军司令官应于长江及淮河口向前逐步占领前进阵地，准备尔后之作战。并下令华北方面军司令官应准备执行关于确保占领区域安定之现行任务，尤须尽力扫荡该地区内之残敌。
而陆军参谋总长-院仁王又紧接着下达了大陆指第161号指示华中派遣军应利用海军中国方面舰队与陆军波田支队在6月13日占领安庆的结果，协同海军伺机占领黄梅、九江一线。而华北方面军则应该确保占据地区内的安定，且应就策应华中派遣军向汉口作战，研究并准备一部兵力向郑州方向前进，牵制中**队第1、第5战区。
华中派遣军在接到大本营的预令后，于6月20日派遣作战主任参谋返回东京，与大本营联系作战问题，确定了以第2、第11军从9月上旬开始攻占汉口附近的要地，虽然首要目标固然是攻占要地，但也将消耗国民政府军的力量作为辅助。尽力迫使中**在武汉形成决战。而第2军的作战方向，则由豫东附近开始，至于向信阳攻击还是向汉口攻击，可以根据具体情况决定。但第2军的作战主要任务只是牵制，以利于第11军的汉口作战。
而负责主要作战的第11军须以主力使用在长江右(南)岸。为使政治、谋略工作紧密配合，在9月上旬以前派遣军主力不要开始作战。但到了9月上旬即使政治、谋略工作还不够充分，也应从六安、九江一线开始作战。航空兵团的主力。编入华中派遣军指挥之下，即第1飞行团属第2军，第4飞行团(轰炸由华中派遣军直辖。汉口作战结束后，立即进行广州作战。那时华中派遣军为策应这一作战，应做好进入长沙附近的准备。
为做好进攻广东地准备，应另外使用第5、第8师团作为战斗投入兵力。
4月至6月间，日本国内此时已经完成了10个师团的扩建，第15、第17、第21、第22、第23、第27、第104、第106、第110、第116师团，这10个师团。除第23师团、第104师团调至满洲的海拉尔、张鼓峰其余8个师团于7月中旬全部调至华北华东。
第104师团在从海拉尔短暂驻屯后，又转至大连准备进攻广州。而由中国驻屯旅团扩编而成的第27师团则是转往杭州。
这个时候，尽管日本陆军总兵力已为34个师团又6个混成旅团，共约90余万人，但由于在中国战场的缘故。其除了在国内留置近卫师团、第11师团两个师团、朝鲜留下第19师团一个师团、台湾留至半个混成旅团外，其余兵力全部投入在中国，兵力约为82.5万人，占其总兵力的91.7%，当然这其中包括关东军个师团，不过就便是这样，在华北、华中方向投入的兵力也是极为惊人的。
根据其大本营的指示，在华日军在将徐州会战、豫东作战后立即正在豫东、皖北地区地第第第6、第9、10、第13、16、第101师团转移南下，并集结于庐州附近地区。又从华北方面及国内刚组建的师团中抽调了第106师团等作战部队，加强华中派遣军。、
这样一来。此时集于华中地区地日军便共有14个师团，而用于直接参加进攻武汉的日军预计多达9个师团的兵力，约25万余人。海军-中国方面舰队为了参加进攻武汉，也集结了各类炮舰、扫雷舰、炮艇、鱼雷艇以及各种辅助舰船总计约100余艘。陆军航空力量、海军航空力量计划参加进攻武汉的部队，共有轰炸机、战斗机、攻击机、侦察机约400余架。早在南京失守后，国民政府最高军事委员会负责指挥作战地军令部就已经对日军的动向作出判断，并提出相应的作战意见，且草拟出《对武汉附近作战之意见》供统帅部参考
按日军的行动而判断，日军华中方面军企图打通津浦线的作战已经很明显了。而一旦打通津浦线后，日军势必当以郑州及武汉为其作战目标。且侵袭郑州及武汉的路线一定会是以一路沿陇海西进图取郑州。以切断平汉线之联络，同时安阳方面的日军沿平汉南下。以夹击黄河北岸的中**队；以一路由庐州经六安、潢川趋信阳，力求截断平汉线，再转而南下进逼武汉；或待陇海一路占领郑州后，再沿平汉线南下取信阳、武胜关，同时以一路由庐州、六安经商城、潢川，再转经麻城、黄安，与平汉路之敌会攻武汉。还有一种可能就是以一路沿长江北岸经大别山脉南麓，由安庆、太湖、宿松、黄梅与海军协同而会攻武汉。
如果日军兵力充足，其还可以在则浦信、平汉两路作战得手后，以一部兵力沿京赣、浙赣两路直趋南昌、长沙或以海军掩护，在九江登陆，沿南浔路进攻南昌，以截断浙皖的第3战区地后方联络线。
所以，无论日军采取任何一种作战部队，都肯定是会占领南昌后，继续向长沙、武汉进逼，而此时日军肯定或是以一路沿浙赣铁路一线进攻长沙，或由南昌经过武宁，越过幕阜山脉而进逼武汉；又或是两路并进，直趋武汉、长沙。
不过考虑到日军的兵力及时间地因素，加上去年进攻南京时，日军的迂回策略而言，则日军从江南方面西进的可能性不大，因为浙、皖、赣边界的地形复杂。且利守不宜攻。日军如果由这一线发起进攻而来，肯定必须需要足够众多地兵力与时间，考虑到现在日本政府和军方已经死抱着速战速决、尽快从中国撤出的思想，故而这一线的可能性不大此。
而去年日军进攻南京时，方才仅仅只能由江南方面对南京形成包围，其越过江北的一路兵力始终显得很是牯岭，如果不是当时因为防御在扬州、**方面的中**队较少，且没有做好相应的准备，江北方向地日军肯定不会取得任何地进展。但现在。如果日军由九江登陆，转而进攻南昌。占领南昌后，再转而向长沙、武汉前进，则肯定需要众多的兵力，而且在没有对浙皖方面地第3战区形成压迫之前。日军将不能不顾虑冒然向武汉进攻，而侧背遭到第3战区打击的可能性。加上这一路同样道路交通很差。
所以根据以上判断下来，日军进攻武汉，必将是从江北地域形成合围，配合沿江而上地部队，进犯武汉。根据上述日军战情判断，以及中**目前的配置情况，最高军事委员会在考虑作战时，即作出了第5战区在安庆方面的部队将沿江北岸。在庐州方面的部队沿浦信线向西撤退；在津浦路方面地部队则沿陇海路向西退却，由徐州、商丘西南转向亳州、淮阳最终退至平汉线郾城、信阳一线。在此构筑防御。而江南方面，第3、第7两战区则形成浙、皖一线对东、沿江对北的两正面的作战架构。就全盘而言，万一战况不利的时候，中**队也可以由湘赣、幕阜山脉、豫鄂皖境内的大别山脉，尤其是在大别山脉的东、北两正面做出布置，将这一线部署为主战场。
因为武汉是中国抗战的政治、经济、资源中枢，故而武汉的得失关系重大，可是武汉三镇地形不好，不易防守，近郊尤以其是江北方面几乎无险可守。而市内更以遍布湖沼。并不是可以久战之地，所以在部署的时候。军委会要求欲确保武汉，则应东守宿松、太湖，北扼双门关、大胜关、武胜关诸险，依大别山脉以拒敌军，并与平汉段之积极行动相呼应。
这倒是不是军委会地一厢情愿，而是实在的构想，如果日军悬军深入，则部署这一线地中**队可临机予以各个击破，或在大别山预为隐伏，待其深入之后，再发起侧击，只有这样方可以确保武汉。否则以武汉三镇为据守点，在近郊战斗，且不说武汉这个政治、经济、资源中心到时候是一片焦土，只有日军对武汉从容形成包围，则守军势如瓮中之鳖，正如去年的南京之战样，成困守之局。所以想要确保武汉就必须在武汉之外展开作战。
再说到时候，中**队万不得已而战于武汉近郊时，不仅可以于武汉以北地区的孝感、花园、广水、武胜关之间配置重兵，形成犄角之势。而日军若以主力直趋武汉，则可以依托武汉外线所构筑的既设工事做顽强抵抗，到时候可以吸引敌的重要兵力集结在武汉外围，同时从孝感、武胜关一线对集结在武汉外围的日军发起进攻，击其侧翼；而日军若不直攻武汉而先攻武胜关、孝感的时候，则武汉守备部队发起出击，策应孝感、武胜关一线的守军。
**方面所提出的守武汉而不战于武汉也便是这个意思，其方才为上策。
所以欲确保武汉，则黄梅、英山、罗田、麻城以至信阳方面的**各部地作战行动，都必须直接参与，这些地带地部队作战可以看作为是武汉中枢外围对作战，所以这些方面各部队都作战指挥，必须与武汉守备部队完成统一，所以岳阳、通城、武安、德安以北、由襄樊、桐柏、长台关、息县、固始之线以南均开辟为战区。