nerv备用总部上方的卫星轨道飞翔着一个使徒，seele提早派出了eva量产机，为了弥补适格者的需求，傀儡系统就派上用场了。
只是力天使的实力也不是吹的，一举吞噬了六台量产机，seele大惊失色，可好在还剩下三台；只要剩余的使徒按照剧本全灭，人类补完计划就能开始了。
现在seele暗中把持着各国nerv分部，配合拷贝版的朗基努斯之枪与不死的生命，以量的优势力压联合国的反对，一意孤行的实施着人类补完计划。
明日香自加持被seele灭口后，心情一直不佳，虽然接到了出击的命令；可明日香无精打采的敷衍了一下；“加持前辈死了，那我还驾驶eva做什么？”
“明日香，你在说什么傻话！”
“美里小姐，你不介意吗？”
“行了，别再沉迷于过去了，你现在应该出击保护nerv与第三新东京市。”
明日香只能点头同意了，“我，明白……”
二号机被弹射到了地面，可鸟天使却什么也不做，继续在卫星轨道上飞翔着……
“还是不行吗？”
“同步率几乎才刚刚合格，加持的死对明日香打击好像太大了。”赤木律子担忧的说道，再这样下去，明日香会失去驾驶二号机的资格。
“都怪seele，要不是为了他们，加持也不会冒险去偷nerv的军事情报！”葛城美里一时气不过，一拳打在了墙壁上。
“真嗣，去支援明日香，现在她根本不是使徒的对手！”
“明白！”真嗣的初号机也被弹射到了地面上，明日香见到初号机，精神更加萎靡了；“觉得我没用了吗？”
“不是这样的，明日香！”
“那为何你来援助我？”
在卫星轨道的鸟天使突然行动了起来，发出了诡异的光线。
“哇啊啊啊！”“怎么回事，不要！”
“是精神污染！”赤木律子马上叫停了，“快撤退！”
“不要过来！”
“母亲，不要让我想起那些事情！”
真嗣与明日香的精神开始崩溃，鸟天使的能力属于非物理性的精神污染，直接让适格者精神崩溃！
“这样不行，真嗣与明日香会受不了的！”
“幻，该怎么办？”
“老爸，是时候拿出来了。”
“……”老爸陷入了沉思，“真的要拿出来吗？seele明摆着就是故意的……”
“你认为还有别的对付方法吗？”我也无能为力，在大气层上方的鸟天使，一般常规武器根本打不到他；seele故意骗鸟天使进攻nerv也是为了逼迫nerv使用朗基努斯之枪。这是nerv最后的杀招，在毁掉拥有s2机关的四号机后，nerv总部已经没有能与seele对抗的武器了。
“丽，去取来……”
“嗯……”丽驾驶着零号机，走向了中央教条……
在同时，明日香的精神还在被鸟天使污染中。
“妈妈，不要，为什么要打开我的过去！”
“明日香……母亲……”真嗣想救明日香，可苦于明日香陷入了过去的痛苦回忆中，动弹不得；初号机也为此被二号机的拖累，无法做出反击。
明日香抱着头，拼命不想回想起当年的痛苦回忆，她的母亲惣流*恭子*齐柏林参与了eva的计划，在尝试与二号机的启动试验时，陷入了与唯一样的处境；虽然成功被救出，可她却精神崩溃的把一个布娃娃当成了明日香；不肯承认明日香是她的女儿。最后选择吊死在了明日香的面前……
“明日香，你想再度失去你母亲吗？”我在通讯外面骂道。
“什么？”
“你想失去驾驶二号机的权限，再度让你母亲成为别人的吗？”
“你懂什么！”明日香从精神污染中暂时脱身，道。“你根本不懂……加持前辈死了，我还有什么驾驶二号机的理由？”
“你母亲的灵魂就在二号机里面！”
“什么？”
我喘了一口气道，“eva的核心材料就是适格者母亲的灵魂……”
“！”明日香惊呆了，一直被误认为去世的母亲，竟然一直呆在二号机里面。“你在说什么？”
“明日香，你没发觉吗？适格者的母亲都无一例外的因为各种理由去世了……”
“……”
nerv内部顿时安静下来，所有人都阴冷的看向赤木律子，作为eva的研发者，她不可能不知道这件事情。
“当时二号机的事故是seele造成的，虽然及时救出了你的母亲，可爱着你的一部分灵魂却被二号机吸收了。”
这也是为什么，明日香的母亲会错误的把布娃娃当成明日香了，她失去了对明日香的印象；在迷茫中选择了自杀。
“母亲……”明日香握紧拳头，“我不会把母亲再让给任何人！”
“同步率……达到了百分之八十！”
“真嗣，你还撑得在吧？”
“嗯！”
“你也不想失去你母亲吧？”
“想都别想！”真嗣大声反驳道，站了起来。
地面上弹射出了零号机，手持着朗基努斯之枪，把枪递给了二号机。
“用这个打败使徒！”
“明白！”“不会浪费的！”明日香与真嗣共同抓住朗基努斯之枪，瞄向了鸟天使的方向……
“明日香，真嗣，我们会一直在你们身边守护你们的……”明日香与真嗣背后出现了加持，还有他们两位母亲的灵魂。
“妈妈……”“加持前辈！”
“加油……”
“嗯！”“明白，真嗣！”
初号机与二号机at立场开到最大，将朗基努斯之枪抛了出去！
朗基努斯之枪一击击穿了鸟天使的生命之果，顺势被插在了月球的表面上……