杨崇量才是举，任命常何、长孙安世、孟孝义为监门将军，李仲文为河源郡郡守，郭善才为海西郡守，卢君业为河南县令，郭子高担任阳城县令，云定兴为军器监负责弓弩坊的副监。
杨崇原来想把云定兴的位置给崔弘丹，可是崔弘丹心灰意冷之下无意仕途，反而愿意去墨焯书院教书，杨崇只好作罢，云定兴的品德有缺，但是在武器方面绝对是个行家。杨侗倒是想找云定兴出口气，可是云定兴老奸巨猾，带着三个儿子云师德、云师端、云师泰负荆请罪，让杨侗说不出话来。
杨崇考虑到实际需要，同意了杜淹的建议，以武德殿为丞相府办公的地方，丞相府官员依旧是越国公府的一帮人，长史还是凌敬，另外增加了司录庾抱、武骑常侍薛德音、铠曹参军褚遂良、郎将史怀义。薛德音是归降的叛臣，杨崇不想让他在聚光灯下；褚遂良则是需要打磨，褚亮还在礼部，不适合更高的位置；史怀义则是史大千的请求，在丞相府过渡一段时间，再到军队任职就不会因为是李唐降将受歧视。
杨崇搬入武德殿，就立即下令提审宇文士及。宇文士及在牢中关的时间不短了，杨崇没有杀他，也不肯放他，让所有人都参不透杨崇的用意，听说今天问案，丞相府立即热闹起来，各个衙门几乎都派人来办公事，就连宇文恺和南阳公主杨慈佑都闻讯赶来。
杨崇没有回避任何人的意思，请宇文恺、杨慈佑、元威、崔处直等人一边入座旁听；宇文士及被押了上来，还是那么儒雅，在牢中的日子没有消耗掉他的自信和底气。见到杨崇，宇文士及施礼道：“见过越国公。”
杨崇示意免礼说：“士及，我们都是熟人，就不说走过场的话了，我只问你一件事，你为什么想帮助李渊谋反？”
宇文士及讥笑地说：“国公弄错了吧，我是在家兄兵败的时候，无奈投奔李唐，你就是心中怨恨我舍近求远，不投靠你，也不用这样故弄玄虚吧？”
杨崇淡定地说：“我是说李渊还是卫尉的时候，你为什么和李渊密谋？”
宇文士及脸上的笑容顿然消失，虽然随即恢复正常，但是望着宇文士及的人都看出，杨崇说到了一个罕为人知的秘密。宇文士及摇摇头说：“我不清楚国公说的是什么意思，归唐后，李渊虽然说我早与他商议此事，不过是为了提高我在李唐中的声望，当不了真。”
杨崇一挥手，焦俊走上前说：“我们查抄了赵行枢所有的私宅田地，在永平坊的一座小宅院里发现了一个布满机关的密室，花了两个半月才打开，在里面除了赵行枢的往来账本，还有赵行枢的日记，记录了他认为可以利用的朝廷大事，关于宇文士及这件事有记录，当时还有赵行枢、韦保峦在场。”
赵行枢原本是太常寺下面的乐户，善于经营，短短十年，家财以亿计；通过云定兴，赵行枢搭上宇文述的关系，做到折冲郎将、虎牙郎将，与宇文化及兄弟交从甚密。在江都，赵行枢与虎贲郎将司马德戡、宇文智及等人合谋发动兵变，弑逆圣天子杨广，推宇文化及为丞相主持朝政，后与司马德戡图谋宇文化及，事败被杀。
焦俊说完退下，孙伏伽出面补充道：“我们验证过赵行枢的日记，根据日记记载的时间，查明李渊、宇文士及、赵行枢、韦保峦那天确实有一个见面的机会，那天是宇文述生日，三人都是去送礼，宇文无及负责接待来宾，但是李渊等人以欣赏书法为名，被宇文士及请到书房。韦保峦在郡守府供认不讳，有书面画押的供词。”
宇文士及的面色不再平静，急切地问道：“韦保峦怎么说？”
孙伏伽没有回答，退了下去；杨崇还是淡淡的语气说道：“士及，韦保峦的事与你无关，你只要说出那个原因就可以了。”
很明显，这个案子杨崇花了大力气，保密至今，就是想对照一下两人的说法，看是不是一样；宇文士及变得很谨慎，拱手说道：“当时杨玄感图谋不轨的事已经流传出来，我们认为杨玄感不足以成事，李渊比杨玄感要强一点。”
杨慈佑一声悲号，宇文恺面无表情，堂上的杨崇、堂下的宇文士及当时都知道了杨玄感的事，不知道的只有中枢和皇族。杨崇笑笑说：“士及，我问的是你们为什么选择李渊，宇文家和韦家的实力都远远超过李家，为什么不谋求恢复宇文氏的天下，或者在代王杨侑身上下功夫。”
宇文士及咬着牙说：“家族当时没有造反的想法，只是我一个人参与，韦保峦也是这样，所以都不及李渊有能力。”
杨崇沉默了一会：“士及，只要你说实话，我可以放了你，你想在长安、洛阳做官也可以，想去江陵继续跟随李渊也可以。”
“杨崇。”杨慈佑勃然而怒，身为大丞相，竟然一点立场都没有，公然与叛贼交易，甚至允许叛贼附逆；崔处直拦住说：“公主，杨崇这么做，必定有他的深意，我们坐着听就行，这里是长安，宇文士及没那么容易走。”
宇文士及凝视着杨崇说：“第一次在宫中见到你，尚书牛弘就说，你是杨素和崔弘度的合体，当时我们都不信，只有昏君杨广点头。杨玄感在关中与各家士族在谈价码，你和杨玄感走得也很近，我们都感觉杨广会败；可是关中人不喜欢杨素，因此不喜欢杨玄感，选择李渊是没有更合适的人选。谁想到被你钻了空子，想必你也不愿看杨玄感成功。”
宇文士及娓娓而述，顺便挑了杨崇两根刺，杨崇靠在椅子上想了半天说：“佛珈大师是你们的人，将杨玄奖和孔颖达送到武威，就是想祸水西引；同样，佛珈大师是你们收买杨玄感手下叛变的执行人，佛珈大师后来参与刺杀我，回到长安自杀，就是因为怕你们说出实情，身败名裂，替铁门寺召来大祸。这么说，周谦和卫玄是你们同谋。”
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