郑芝龙这个在福建盘踞了十余年的军阀，至少替大明抵御了尼德兰人的海洋攻势，一再打退尼德兰人的攻势，阻止尼德兰人对大明沿海渗透，可以说是功大于过。
方原对郑芝龙还是保持了一种尊重，并不是召他前来训话，而是在郑芝豹的带领下，亲自到郑府，拜见了郑芝龙。
郑芝龙颓然坐在帅位上，既不行礼，也不说话，只是直直的瞧着方原，瞧着这个一手葬送了郑氏基业的年轻统帅。
胡琦指着郑芝龙坐着稳如泰山，喝骂说，“郑芝龙，你一个败军之将，还不快向方总督负荆请罪！”
郑芝龙哈哈大笑说，“我郑芝龙纵横海疆之时，什么方总督还在玩尿泥。我老了，也没几个年头活了，要杀就杀，我不受辱！”
郑芝豹脸色大变，也不知兄长如此触怒方原，会不会遭来未测的打击报复。
方原拍了拍胡琦的肩，令他退下几步，这才冲着郑芝龙深深的鞠躬行了一礼。
郑芝龙没摸清方原是不是想先礼后兵，冷冷的说，“败将之将，受不起啊！”
在众人惊愕的目光，方原缓缓的说道，“这一礼是感谢郑总督为大明抵御尼德兰人的敬重，郑总督当然受得起。”
郑芝龙愣在当场，方原胜而不骄的气度令他是大为错愕，相较之下，他一个败军之将还装大爷一样坐在堂上，就是惹人笑柄。
他忙起身冲方原也回了一礼，“败军之将，何以言勇，任凭方总督处治了吧！”
方原淡淡的说，“从今以后，打击以尼德兰人为首的佛朗机人，就交给本督了，郑总督就安心做个田舍翁也好，当个富商也罢，安安分分的在南安老家过日子吧！”
他环视了郑芝龙兄弟一眼，又说道，“郑森还在负隅顽抗，郑总督千万莫再有异心，与之暗地里勾结，否则，本督只能以谋逆惩处。”
所谓谋逆惩处，就是族诛郑氏满门。这也是方原对郑芝龙兄弟最后的警告。
郑芝龙颓然的坐在虎皮大椅上，连声说道，“好！好！我郑氏已认输了，至于郑森要死要活，与我郑氏再无干系。”
方原得到了他的承诺，虽不知真假，但还是决定放过郑氏一门，“好，郑总督交出五百万两银子，六十万亩土地，半个月内搬去南安县吧！”
方原转身出了郑府，郑芝豹赶紧追了上来，恭敬的说，“方总督，田契、银子，我会如数的送来。只是，郑森他，只是年轻气盛，方总督能否宽容宽容，容我再去一封书信，劝他来降。”
在历史上，郑森就是刚愎自用，血性刚烈的英雄，这种人是宁可战死，也绝不会投降的。既然郑芝豹要去折腾，就由得他去折腾。
方原突然想起了一人，那就是躲在福建避难的钱谦益，这个东林老贼必须捉回去凌迟处死！
方原拉着郑芝豹问道，“曰文，钱谦益这老贼呢？”
郑芝豹如实的说道，“还未开战，钱谦益就不知所踪，听说是逃去广东，投靠一个相熟的粤商。”
“这个钱老贼，还溜得真快！”
方原暗暗失望，他也不可能为了钱谦益，再派军去广东抢人，只能暂时作罢，拍着郑芝豹的肩说，“曰文，今次收复福建，你是立了大功。论功行赏，我封你为南直隶总兵，随我回南直隶去。”
郑芝豹还以为郑氏一投降，所有的前程都化成了泡影，未曾想到方原还愿用委以重任，郑芝豹是感激涕零，冲他再次跪拜。
方原与郑芝豹告辞后，令胡琦找来了那个在仙霞岭投降，想向方原某个好营生的百户刘根。
刘根到了后，正要拍马屁讨好，方原开门见山的说，“刘百户，我方原是有功必赏，现封你为千户，领一千卫所军士。主要职责，就是在南安县看管郑芝龙，还有郑氏族人，一旦有风吹草动，立刻向上报浙江总兵上报。”
刘根眼珠儿转了转，揣摩过方原的心思后，试探的问，“方总督所谓的看管，是不是要......”
他伸出手指，在脖子上划了一下，暗示方原是不是要暗中斩杀郑芝龙，还有郑氏族人，永绝后患。
方原见他在自以为是的邀功，失笑说，“本督是那种出尔反尔的人？令你好生看管，就是防备郑森派人与郑芝龙暗中勾结，明白了？郑芝龙保护大明海疆二十年，功勋卓著，单凭这份功劳，只要他不再起兵祸，本督就要他安享富贵的晚年。不要自作主张去令郑芝龙受辱，否则本督必然严惩。”
方原本不需和刘根废话这么多，但担心自己离开福建之后，刘根自作聪明的产生什么误判，虐待、敲诈勒索郑芝龙、郑氏族人，不得不袒露保护郑芝龙的心迹。
方原布置好了监控郑芝龙一行的军士，思绪却到了那个撤离的郑森身上。郑森是他的死敌，但他对这个敌人打心眼里还是敬佩的。为了理想、信念，屡败屡战，决不妥协，血战到底。比之郑芝龙，郑森绝对当得起乱世英雄之名。
让这个乱世英雄就这么逃走了，确实是个心腹大患。但南直隶军情紧急，方原也没时间留在福建继续追击郑森，只能希望前去伏击的赤古台能出现奇迹，击杀郑森了吧！
郑森一行郑军撤出安民关，刚刚出了山口，行出一日，便遭到玄甲铁骑的截杀。
郑森这才知晓，一切全在方原的算计之中，甚至连他的退路，方原都算计好了。
赤古台率领的玄甲铁骑兵，自攻打福建后，还没上过一次战场，没军功就没银子、田地，早憋得浑身痒痒。如今一见到撤退的郑军，就如同饿虎见到了羊羔，凶猛的扑咬而来。
玄甲铁骑兵锋太猛，周全斌只能率五千郑军殿后，掩护郑军的主力撤离。
双方僵持了两日两夜，赤古台一番冲杀下来，打得周全斌所部是溃不成军。这五千郑军本就是弃子，送来喂饱玄甲铁骑，以掩护郑森两万郑军，一万蛮兵撤离的。
周全斌稍作抵抗，见兵败如山倒，立刻便率领百余亲兵连夜逃了，逃过一条大河时，便将过河的木桥全毁了。
赤古台追杀而至，却被大河挡住了去路。若要搭浮桥而过，至少需要两日。况且他对衢州、处州、温州三府的地形根本不熟悉，再追杀过去，前景莫测。
赤古台便选择了偃旗息鼓，带着歼灭五千郑军的胜果，回去向方原复命了。
郑森一行郑军逃脱了玄甲铁骑的追杀，经过七日七夜的急行军，终于赶到了温州府的金乡卫休整。
偷偷率金门水师北上的刘国轩早已等候多时，他此行带来了九十艘战舰，五百艘从金门岛征用的民船，就是来接郑森前去金门岛的。
郑森被方原追得穷途末路，只剩下三万残兵，未来的出路是一片茫然。整个福建全投降了，甚至施琅的舰队还驻扎在镇海卫，厦门岛，对郑家的残兵是虎视眈眈。
反攻福建，郑森暂时是不用指望了。
他眼下唯一的选择，就是采用刘国轩的建议，先逃去金门岛休整，整军备战后，攻占尼德兰人的台湾岛，再以台湾岛，还有吕宋等地的民力，与方原继续周旋到底。
郑森坐上了金门水师的主舰，最后一次回望了大陆一眼，冲着仅存的两员大将刘国轩、周全斌，沉声说道，“我郑森绝不认输，总有一日还会回来和方原一决雌雄！”
二将是轰然领命，一行舰队驶离了金乡卫，消失在茫茫大海之中。