话说巫族自从巫妖大战之后残余的巫族众人，要么回归洪荒极北之地祖巫殿中留守祖巫殿闭关不出，要么进入幽冥地府，要么远遁洪荒星空，无论是大巫、小巫、巫人都不再出世，基本上可以说是绝迹洪荒。
不过那时人族和巫族经过那么多年的混居，人族中也或多或少的留下了许多巫族血脉，特别以人族南疆畎夷、于夷、方夷、黄夷、白夷、赤夷、玄夷、风夷、阳夷九个部落为最，合称九黎，基本上人人都有巫族血脉，而且也时有觉醒之人，因此部落中人人人勇猛非常，最是好战，在人族中也是有数的大部落。
却说这轩辕出生不久，畎夷部落也降下一子，乃是畎夷部落族长之子，生有一十七斤重，手腿壮硕，头生双角，生而能言，自名蚩尤。如果蚩尤出生在其他部落，可能会被当成怪物看待，可是在九黎却被看成勇武象征，况且当时伏羲、神农之流都乃生有异象之人，族人们也认为蚩尤乃是上天赐予部落的宝贝，乃神灵转世，因此族人们都非常看重他。
这蚩尤果然不负众望，天生便有千钧神力，徒手撕裂虎豹犹如儿戏，一身凶悍煞气，洪荒异兽亦是不敢招惹于他。畎夷部落族长看到自己的儿子蚩尤如此勇猛，并且能征善战，大喜，于是在蚩尤十八岁的时候便将族长之位让给了他，族人们也都无有不服之人。
你道这蚩尤何许人也？上文也提到巫妖大战中第十三祖巫虽然身死，而一丝真灵却飞向六道轮回，这蚩尤正是第十三祖巫蚩尤转世。可能因为身怀巫族血脉，并且极其亲近巫族的缘故，蚩尤出生不久后血脉就觉醒了，而且也记起了前世的种种，蚩尤发现现在乃是人族为天地主角，知道巫妖二族大概都失败了，心中伤心不已，不过他知道凭借现在的巫族是不可能恢复昔日荣光的，不说现在巫族式微，不能和现在的人族相抗衡，就算能，那些圣人和大神通者也是不会允许的，最后大概只能落一个族灭的下场，何况自己现在并非乃是纯正的巫族了。
不过蚩尤还是不想放弃恢复巫族昔日荣光的想法，至少也要巫族能够和人族一样正大光明的生活在这天地之间，而不是如现在那样蜗居于祖巫殿或幽冥地狱之中，因此蚩尤想到了一个方法，自己虽然有巫族血脉但也有人族血脉，如果自己能够成为人皇，那么就可以以人皇的名义重兴巫族，恢复巫族昔日的荣耀，和人族一起自由自在的生存在这片天地之间。这样不但是在圣人可以的接受范围之内，不会为巫族带来灾难，而且自己也可以成就人皇果位，如圣人一般不死不灭，得享永恒，这可是自己和其他祖巫们一直以来的目标之一。能有这个机会，蚩尤当然不会放弃。不过现在轩辕已经成为了人皇，蚩尤想要成为人皇，那就只有将轩辕从人皇之位拉下来，那得首先有实力才行。蚩尤继承了巫族血脉，还是不明天时，却不知人皇之位上天早已注定，还想不自量力，妄抗天道。
于是蚩尤自从继任族长以来，便以巫族秘法开始训练族中勇士，随后凭借实力统一了九黎部落，将九个部落合并成了一个大部落九黎部落。
一统九黎后，蚩尤将部落划分为八十一个部分，又从中挑出族中实力强大的八十一个族人于之结为兄弟，每个兄弟管理一个部分。这八十一个族人都觉醒了巫族血脉，蚩尤又将巫族神通传给这些兄弟，众兄弟纷纷神通大增，都达到了小巫境界。
蚩尤知道自己和八十一个兄弟都非纯粹的巫族，是以依照十二都天神煞大阵改变编成九九寂灭大阵。由自己主掌中央，八十一位兄弟主四方，此阵威力虽然远不如那十二都天神煞大阵，可也算是洪荒杀阵。这蚩尤却也不凡，他知道自己这世不说没有祖巫精血，更不是纯粹的巫族，想要达到前世祖巫的高度却是想都别想，因此结合巫族神通并参照冥河老祖的血海神通等的众多洪荒法门创造出了属于自己的魔道法诀，命名为天魔诀。
凭借着天魔诀，蚩尤短短二十多年时间就达到了太乙金仙的水准，并且肉身强悍之极，却是不比大巫真身差，练到极处肉身将不死不灭（当然也是相对的）。蚩尤还努力和八十一个兄弟以巫族秘法训练族中勇士以为巫兵，经过十多年的准备，族中的士兵都训练成了打起仗来不怕死、不怕痛，并且勇猛异常的巫兵，而且这时候轩辕正在进行划分州野、建立城池、加强中央集权的工作，引起了诸多部落的不满。蚩尤觉得时机以至，于是准备起兵讨伐轩辕，借机夺得人皇之位。
不过正当蚩尤想要起兵之时，有姜部落的榆罔就先起兵了，因此蚩尤就先按下起兵之念，准备先看看轩辕的实力，坐享渔翁之利，并趁两者两败俱伤之时，乘机出兵，夺得人皇之位。可是结果却和蚩尤想象的截然相反，想不到榆罔却是如此没用，居然很快就被轩辕打败了，而且最后结果更是出乎了蚩尤的预料，有姜部落居然和有熊部落合并成了炎黄部落，最可怕的是轩辕在此战之后气势大盛，隐隐已经有了一统人族的气象，其它部族都纷纷表示臣服。蚩尤知道自己却是不能再等下去了，如果等轩辕完全一统了人族之后，自己就再也没有希望了，于是就马上召集八十一个兄弟商议，随后八十一个兄弟纷纷点齐自己的部下，在蚩尤的带领下朝陈都而去。
自从轩辕打败榆罔之后，各种政令通畅无阻，中央集权也得到了很好的实施，其中益处也很快就显现出来了，人族也变得更加兴旺了，轩辕看到这些，心中大是欣慰，自己的努力总算没有白费。这时，却突然听到部下来报说南疆九黎部落蚩尤来袭，轩辕心中大惊。
原来前些日子轩辕就收到了部下来说南疆区域政令难以很好的通行，中央集权也时时受阻，轩辕以为南疆乃是不毛之地，可能是教化不够，因此也不太看重，等其他地方处理好后在来处理南疆事务。不过这时候听到南疆九黎族蚩尤来犯，心中大惊，继而又大怒，想不到人族内部战争才刚刚过去没多久，就又要开始战争了，不知道这次又要死去多少族人。
不过轩辕毕竟是轩辕，既来之则安之，心中一定，马上召集群臣前来商议，随后便召集士兵，以人文始祖仓颉为军师，自己亲自挂帅前去迎战蚩尤。