宣布胜利，并不意味着此战中暴露出来的问题就过去了。尤其是杨国昌等老军官在对待航空作战上的失误，最后时刻面对数倍日机时的不冷静，引发海军内部的强烈地震。在舰队回到基隆的当夜，23舰队司令杨国昌，参谋长林若盛均被解职，随后被调往海军大学，虽然没有降级，但也意味着两人的海军一线生涯到此结束。同时台湾海军守备司令，参谋等十几名高级军官也被解职。四川号更是接受到开战以来的最严厉处罚，因为在吃到四枚鱼雷和五枚炸弹后，四川号本来还有希望挽救，但损管却出现严重疏漏，在夜晚风浪加大后没有采取加固措施，导致航母翻覆，所以包括舰长、负责损失管理的军官等二十五人被逮捕送交军事法庭。
与世界各国海军一样，民国海军也有战列舰派和航母派，甚至因为当年的青岛海战，还多出了潜艇派。但琉球海战后，战列舰派和潜艇派都意识到航母成为主力已经不可阻挡，于是一批年富力强的新生代航空派军官开始崭露头角。针对飞行员汇报，闪电明明技术占优，但大家却很不适应的问题，海军也积极应对。在统计后发现，此次损失绝大部分都是因为不熟悉日军的作战方式和零式战斗机超强的小半径盘旋能力，很多飞行员都用对付西线苏联空军的方法去打灵活性很强的零战，而一直被用于模拟零战的厉风在盘旋和垂直能力上都不如机体更轻的零战，所以第二天海军部就下发调令，将章鹏、雷少保和刘宇等几名优秀飞行员调回海军航空兵学院，向大家传授对付零战和日本军舰的方法。
“不能推迟关岛战役！”
面对海军希望将偷袭关岛的时间推迟的想法，杨秋狠狠地一拍桌子：“不就丢了一艘航母吗？就把你陈绍宽吓死了？山本五十六才几艘航母？有什么担心的。本土和东南沿海的安全不用你操心。我只要关岛。马里亚纳和西南太平洋！就算全打光，也要拿下来！”
总统府内，杨秋的脸色也不好，这番怒火与其说是教训海军，不如说一大半是在说自己。因为现在想来，其实不应该派23舰队执行琉球海战的任务，就算留下凤翔和瑞风号，两艘轻型航母也不会构成多大威胁。陈绍宽和海军其实是代他受过。因为派23舰队去是他决定的，海军只是尽职的执行总统的作战计划。才使得23舰队两艘航母一死一伤，也导致偷袭关岛的计划将缺失了重要空中力量。这也是典型地外行指挥内行的战役，因为他除了知道航母是未来霸主外，连航母起降怎么安排都不懂，更别提零式战斗机的弱点这些专业问题了。
陈绍宽被骂后脸色铁青。垂头坐在边上不说话。王正廷在杨秋身边时间最长，看出他其实是自责，只是这种场合下还是要照顾总统的面子，所以主动插嘴缓和气氛：“厚甫，你也别生气，总统要是不支持你们海军，早几年就不会挤出牙缝拨款造那么多军舰。”见到陈绍宽脸色稍有缓和。他继续问道：“对了，我记得36年海军计划时就开工四艘辽宁级，38年补充计划补充六艘，去年对苏宣战后又增加六艘。怎么一点周旋余地都没有呢？”
“36年的四艘我们是按照常规建造速度要求船厂的，速度慢却可以节约成本。前四艘中，辽宁号在印度洋舰队，二号舰安东号已经交付第二舰队开始海试。三号广东和四号广西的舾装都接近完工。”陈绍宽介绍道：“38年的六艘建造速度比较快，但大部分也都才下水舾装。开战后的六艘有半数还没铺龙骨呢，所以我手里现在只有五艘能打的舰队航母和四艘护航航母。印度舰队的三艘不能动，那是准备打安达曼群岛和缅甸用的，还要策应波斯湾、防止德意进军苏伊士运河。第一舰队的两艘北海已经去基隆，第二舰队的安东号还没形成战斗力。除这些外，第二批六艘护航航母已经改造过半，最快月底就能交付一艘。不过护航航母速度慢，就算现在出发去也要十天后才能到关岛......。”
听完介绍后，文职官员才明白，海军不是缺航母，而是恰好处于一个空档期。毕竟从1936年至今，就已经有十几艘舰队航母陆续开工，所以陈绍宽才想将关岛战役推迟到十月。空军司令贺宁想想说道：“厚甫，我有个想法。辽宁号服役至今也没听说有什么设计缺陷和故障，你不如立刻结束海试，将贵州号的第六航空大队调上去。这样既能把安东号立刻拉出来，也能确保战斗力。再把四川号的第五航空大队加强给两艘护航航母，凑三艘先去支援关岛。只要机场拿下来，我立刻派两个天权大队支援你。天权的航程应该可以稳住整个群岛的形势，对海进攻也可以用轰炸机和俯冲机配合。只要守到年底，你也有七八艘航母可以用了。”
贺宁的话提醒了大家，顾维钧也献计献策：“贺宁这个办法好，我看广东和广西号也可以缩短海试，要是还不够，干脆把一些不重要的舾装任务停掉，确保先服役，后面有时间再慢慢装。”
“是啊，厚甫。战时就别扣得那么紧。你看我们，交付的坦克都冒着黄油味，连发动机试车都没做过，还不是照打不误。”
众人的建议中，岳鹏也轻轻咳嗽两声，打断道：“我同意总统的意见，关岛不能推迟！根据最新的情报，罗斯福提出的租借法案已经进入国会审核程序，从反馈看美国国会和民众对参战抱有怀疑，但对英法却有相当大的同情，所以三周后的参议院全体会议上通过的可能性很大！一旦通过这部法案，美国参战的道路也就基本铺平，罗斯福肯定会在十月连任后正式参战！所以这是我们控制西南太平洋的最后机会，必须在十月前将关岛和马里亚纳群岛拿在手里，战后才能取得托管权，切断威克岛至菲律宾的航线。只有这样，才能确保美国参战后履行美菲保护协议，以菲律宾为跳板长期的插手西南太平洋！”
在座的谁不知道，战争只是表象，背后各大国的角逐才是关键。欧战一举奠定英法二十年的超级大国地位，随着中美苏德的崛起，世界已经到了重新划分的时刻。即使是盟友，谁不是留着几个心眼，恨不能拉对方垫背。现在的关岛和马里亚纳还不是美国领土，所以趁美国参战前控制，就等于切断了从夏威夷至菲律宾的航线，如果能从日本手中抢到拉包尔、所罗门和新几内亚，就可以宣布除澳大利亚外的西南太平洋全部成为民国内海，到时就就算美国回国菲律宾，也起不到遏制作用，因为民国可以随时切断美菲的海上联系。
所以回到海军部后，陈绍宽还是接受了杨秋的想法，连夜召开会议，决定将海试的安东号航母立即编入现役，同时调第五航空大队前往，以便迅速形成战斗力、还派军代表去船厂，一定要赶在年底前将广东和广西号两艘航母完工。而38年初开造的第二批六艘辽宁级也被排到最优先位置，所需资源全部开绿灯，确保最早在明年初陆续服役，最后还启动了第三批六艘护航航母的改装工作。
尽管琉球海战余波还在扩散，但西南太平洋的战云并未散去，相反战鼓还越来越密集。海军已经意识到，必须再来一场海上大决战。所以在琉球海战结束当夜，第二舰队两艘将军级护航航母离开湛江接替23舰队驰援关岛，同时三都澳的安东号也在第二天清早急追而。第一舰队两艘北海级航母进驻基隆，同时北京号和南京号战列舰被调往第二舰队接替两艘安海，增调三个岸基海航大队进驻台湾、婆罗洲和纳土纳。在两艘航母一死一伤的情况下，仅用一天一夜时间，民国海军又在西南太平洋云集起七艘航母，1000余架海军战机。加上空军，从纳土纳到台湾的西南太平洋，总部署战机数量超过2000架，这还没算上海以北沿海的海空力量。
面对中国海军咄咄逼人的态势，日本联合舰队总司令山本五十六却头疼无比。虽然源田实的计划取得效果，但还是被三艘主力舰逃走，而且飞行员的损失相当大！从羽地内海到结束，一个白天日本海军就损失约130名有经验的精锐飞行员。谁都知道，飞机好造，飞行员难养。尤其是日本海军的精兵政策，更导致海航飞行员奇缺，让他空有航母却无法进攻。不过他也和民国一样，立即致电东京，要求立即建造更多航母和飞机。
就在他到处想办法筹措飞机和航母时，却不知道夜袭和琉球海战仅仅是整个中国海军突袭计划的一部分，更大的灾难还在等待着他和日本。